（1）含中药“十八反”、“十九畏”药味中成药的配伍禁忌。医师平时开中药饮片时，通常很小心，因此，“十八反”、“十九畏”一般不会出现。但是这些情况在中成药联用时就容易忽视。比如，治疗风寒湿痹的大活络丹含有附子，而止咳化痰的川贝枇杷露、通宣理肺丸等含有川贝、半夏，如果是一位患风湿病的病人同时患有咳嗽，联用了上述药物，则违反了配伍禁忌。
    （2）中成药联用时，所含有毒成分的增量与叠加。几种功效相近的中成药联用，在各自的组成中，往往有一味或几味中药是相同的，如果不注意，则会造成其中的一味药或几味药计量增加。如大活络丹与天麻丸均含有附子，朱砂安神丸与天王补心丹均含有朱砂，如果上述药物联用，则增加了有毒药物的剂量，加大患者用药的风险性。
    （3）不同功效药物联用的辨证论治和禁忌。附子理中丸与牛黄解毒片联用，附子理中丸是温中散寒之剂，适用于脾胃虚寒的胃脘痛、呕吐、腹泻等，而牛黄解毒片性质寒凉，是清热解毒之剂。如果将这两种药联用，一凉一热，药性相反。显而易见，是不适宜的。
    （4）药物相互作用问题。中药麻黄有升压的作用，忌与降压药如复方罗布麻片同用，也忌与扩张冠脉的中成药如速效救心丸同用。因为麻黄中的麻黄碱的化学结构与肾上腺素相似，其可使血管收缩，血压升高；另一方面，又能兴奋心脏，增加心肌收缩力，使心肌耗氧量增加。若同时与扩张冠脉的药物联用，会产生拮抗作用。